朱元璋晚年，有两件事给他带来沉重的打击，一是迁都的失败，二是太子朱标的去世。
洪武二十四年，公元1391年，朱元璋派太子朱标巡视关中，为迁都西安作准备。
朱标详细考察了西安和洛阳，比较两地的地形，然后，回来后向朱元璋献陕西地图。
朱元璋正要朱标全力主持迁都事宜，哪里知道，朱标自秦中视察返京后不久，便患上了病症。
他在生病期间，还向朱元璋上书关于筹建都城的事。
第二年，朱标就病逝了。
朱元璋是白发人送黑发人，年近七十的他，受到如此沉重的打击，再也没有精力和心情考虑迁都的事情。
他在这一年的年底，亲自撰写的一篇《祀灶文》，文中表达了自己万般无奈的心情：“朕经营天下数十年，事事按古就绪。惟宫城前昂后洼，形势不称。本欲迁都，今朕年老，精力已倦，又天下初定，不欲劳民。且兴废有数，只得听天。惟愿鉴朕此心，福其子孙。”
我们知道，朱元璋一向都是我定胜天的样子，如今说出这样无奈的话，真是异常凄凉，知道自己再厉害，终究还是厉害不过老天！
国都一事，便成了朱元璋一生最大的遗憾，至死都没有妥善解决。
洪武三十一年闰五月初十，公元1398年6月24日，年迈的朱元璋，终于抵挡不住老天，驾崩于应天皇宫，他下遗诏说：“朕膺天命三十有一年，忧危积心，日勤不怠，务有益于民。奈起自寒微，无古人之博知，好善恶恶，不及远矣。今得万物自然之理，其奚哀念之有。皇太孙允炆仁明孝友，天下归心，宜登大位。内外文武臣僚同心辅政，以安吾民。丧祭仪物，毋用金玉。孝陵山川因其故，毋改作。天下臣民，哭临三日，皆释服，毋妨嫁娶。诸王临国中，毋至京师。诸不在令中者，推此令从事。”