重新回到朝廷的张居正，对皇帝管束得越来越严！
皇帝备办六宫赐物，太仓提供的钱财很多。
张居正就户部呈皇帝过目的清单发表意见，称每年太仓入不敷出，奏请皇帝坐下休息时抽空浏览一下清单，量入为出，节省过量的开支。
他的奏章送上去，皇帝留了下来。
朱翊钧又命令工部铸造钱币支付开支，张居正认为获利抵不上耗费制止了此举。
有些官员劝谏皇帝，奏请在苏、松地区停止织造活动，朱翊钧不听。
张居正见了，当面向朱翊钧奏请，朱翊钧无奈，这才同意减去大半。
张居正还奏请皇帝停止修建武英殿，以及裁减对外戚升官的恩惠，皇帝多数违心地顺从了他。
朱翊钧到文华殿，张居正侍讲读完毕，告诉皇帝给事中呈送的有关灾害的奏章，请求赈济。
他又说：“皇帝爱民如子，但是有司们在外损公肥私，盘剥百姓欺骗皇帝，应该依法严惩。皇上努力节省，把宫中的一切开支、服饰、赏赐物、布施品，裁减或禁止。”
朱翊钧点头同意，对一些地方税粮予以蠲免。
张居正认为江南的贵族豪强仗势违法、奸诈狡猾的官吏和百姓长于拖欠赋税，挑选精悍的大官吏严格督导责罚。赋税因此按时输送，国库日益充实，但是豪强和狡猾的官民都怨恨张居正。
张居正还联合了内宫的冯保，早晚巡视皇帝的起居，皇帝稍有不是，马上报告给慈圣皇太后。
慈圣皇太后管教皇帝很严格，每次责备他，就说：“假使张先生知道了，会怎么样？”
朱翊钧因此很害怕张居正。
他逐渐长大后，心中开始厌烦张居正。
对比起乾清宫小宦官孙海、客用等人，他们陪伴皇帝游玩戏耍，比起日夜板着脸的张居正来，那是天壤之别。
一个人，开始讨厌一个人的时候，那是厌烦见到他；逐渐发展下去，由厌到恨，恨不得让他死去！