陈兵三四万人的鸭绿江防线崩溃，辽东重镇接连失守的消息陆续传入京城，翁同龢的结论是李鸿章指挥不力，淮军已经不可依靠。庆亲王奕劻也认为再靠李鸿章指挥已是力不从心，但他不像翁同龢一样单纯认为是李鸿章的能力问题，他认为目前参战的还有八旗、绿营、练军，都非李鸿章能指挥得动，而且从山西、河南等地调往京师的军队正在云集，非德高望重者不能指挥。于是他有一个主意——成立督办军务处。
他的设想是，督办军务处由恭亲王任督办，他则任帮办；会办则有翁同龢、李鸿藻，这两人深得光绪帝的信任；另一个是荣禄，已经代替福辊出任九门提督，而且荣禄又深受太后信任；再一个是兵部侍郎长麟，职责所在，自然少不了他。奕劻先与翁同龢密商，翁同龢无不赞同。近来太后已经到了无事不过问的程度，因此奕劻递牌子进宁寿宫密陈他的建议，太后也立即同意。
翁同龢、李鸿藻的地位已有深固不摇之势，进军机是势所必然。目前的军机班底是醇亲王和慈禧十年前奠定，世铎是领班军机，不宜轻动；孙毓汶为太后赏识，也动不得；徐用仪是孙毓汶六月份才荐入军机上学习行走，没有逐出军机的必要。剩下的就是额勒和布、张之万，两人年龄已大，体面地休致回家，其空位就由翁、李两人替补。
翁同龢还力荐一个人入军机，此人名刚毅，字子良，他他拉氏，满族镶蓝旗人。他是刑部笔帖式出身，用心钻研大清律例，光绪元年翁同龢任刑部侍郎，对他十分赏识，派为“秋审处总办”，主持死刑犯的勾决。轰动全国的杨乃武和小白菜案就是他具体审理平反，随后升江西按察使，后为广东、云南布政使，擢山西巡抚，后又任江苏巡抚，广东巡抚。他与翁同龢关系极厚，这次也是奉诏进京祝寿，与荣禄一样，在翁同龢的力荐下留京任职，出任礼部侍郎。翁同龢称他是“结实人”“清廉明快”，认为可借他来整饬吏治。此事太后也无意见，所以当天内阁就明发上谕，公布了新军机的人选。