在上文中，阿尔都塞分析，意识形态是人类社会的客观结构，是人们体验世界的必要的中介，这是他对意识形态作为一般社会结构的揭示。但是，在其师巴什拉的科学认识论的影响下，阿尔都塞认为，意识形态不仅在社会历史中发挥一般作用，它是一种客观的总体认知结构，是一种与“科学”相对的、资产阶级的问题式。值得注意的是，这里的认知结构既不是具体到个人主体的认识过程，也不是我们传统的主客体的二元认知构架。阿尔都塞正是从反对这一二元认知怪圈出发，揭示出西方哲学史传统认识论中的意识形态问题式，以完成“认识论断裂”（coupure épistémologique）而走向科学的问题式。
首先，让我们认识下阿尔都塞的问题式概念。在法文中“问题式”（problématique）的原初意义是提问方法或可疑的，阿尔都塞是从他的好友雅克·马丁那里借用了这一概念，“以指出理论形态的特殊统一性以及这种特殊差异性的位置”[10]，也就是用来指认问题生成背后的主导隐性构架。值得注意的是，这个问题式，绝不是在个人主体的具体认识过程中，而是在宏观历史总体上指认的客观的认知结构。它发生在客观的历史的思维过程中，而不是发生在个人主体的思维中，这显然是阿尔都塞受到结构主义和巴什拉科学认识论影响的结果。所以，阿尔都塞强调的思维，不是单个个体的意识活动，不是超验主体的绝对能力，而是具有客观结构的现实体系。
“思维”是特有的现实体系，它是在同自然保持着一定关系的一定历史社会的现实世界中产生和形成的，它是一种特殊的体系，它是由它的存在条件和它的实践条件所规定的，也就是说是由特有的结构（une structure propre）规定的。[11]
如此一来，不论是思维活动，还是认知过程，在阿尔都塞的结构主义思想下都是客观生成的宏观结构，个人主体及其具体的认识活动都如同历史中的小波澜可以被忽略不计，真正发生决定作用的是社会历史背后的宏观结构。所以，在阿尔都塞看来，意识形态问题式是一种宏观的认知构架，并且整个西方哲学的认识内容背后就是意识形态的问题式，其问题式的秘密就藏在传统的主客体二元认识结构中。