一般传染病，病人是主要的传染源，隔离是把传染病人与健康人分开，杜绝传染机会，以限制和扑灭传染病的蔓延。这在传染病的管理上有极重要的意义。许多传染病都是在早期传染性最强，所以早期隔离病人是控制传染病流行的重要环节。但是，在最早期要想确诊疾病是有一定困难的，因此如有可疑病儿，即使当时不能确诊，也应将其隔离。
（一）对患儿的隔离
一旦发现患传染病或有可疑病者，应迅速将其与健康儿童隔离。隔离应有单独的房间或隔离室。隔离后的患儿应有专人细心护理、治疗，按时给病儿吃药、测体温、详细记录病情，并合理安排他们的生活与饮食，这不仅能防止传染病的蔓延，还能使病儿得到个别的照顾，有利于健康的恢复。
患不同传染病的病人，应分别隔离，以免相互传染。如麻疹的病原体是病毒，而猩红热的病原体则是乙型溶血性链球菌。如果不分开隔离，交叉感染，既患麻疹，又患猩红热，那很危险。
隔离室的工作人员要固定，不串班，不与健康儿童接触，不进厨房，进入隔离室要戴口罩，穿隔离衣，离开隔离室时要脱去隔离衣，并用来苏水或肥皂仔细洗手。
隔离室的玩具、用具，必须单独使用，并定期消毒。病人吃剩的东西，绝对不能再让别人吃。照顾健康班的工作人员不能进隔离室。对患儿的隔离时间应严格按各传染病规定的期限。
（二）对接触班的隔离
对接触班的隔离是将与急性传染病患儿所在的班和其他未接触病人的儿童隔离，直到该传染病最长潜伏期终了时再无新患者发现为止。其主要目的有两个：一是有利于密切观察早期症状，早期发现续发患者以便管理；二是切断传染途径，使以后再有患者和带菌者出现，也不致危及已隔离的易感者。对接触班的儿童要进行医学观察，并采取必要的防治措施。观察他们的饮食、精神、大小便、体温等是否异常，安排好一日活动，适当增加营养，并随时将护理观察的情况告知医生，打预防针，服预防药，达到有病医治、没病防病的目的。就是传染上了疾病，也可减轻患儿的症状，缩短病程，加速康复。观察期间，接触班不收新生入园，不混班，不串班，做到分散活动，以缩小传染范围。尽量使传染病的流行终止在一个班上。除此之外，还应对接触班进行彻底消毒。