根据综合高中人才培养目标的多元性、课程类型与内容的多样化，相关部门应鼓励学校积极探索分层与分类相结合课程实施模式。分流前按能力分班、分流后按类型分班、跨班跨年级和跨校的分层与分类教学多等种方式，为开展富有针对性的教育教学、合理而有序地落实各类课程提供保证。
综合高中设置四个课程模块：基础课程、学术课程、技术课程和拓展课程。基础课程要满足高中毕业会考的基本要求；学术课程要建立分层机制；技术课程要根据职业领域分类；拓展课程包括兴趣辅导、生活辅导、升学指导或就业指导等内容。根据综合高中的办学特点，高一年级安排公共必修类基础课程；高二年级按照学术类和技术类分模块安排课程，学术类和技术类课程分为必修和选修两个类别，互通互选。学术类学生要修技术类学分，技术类学生要修学术类学分。高三重点开展拓展类课程，主要是升学指导或就业指导类课程。
学校在保证开设所有必修课程模块的同时，要积极创造条件，制定开设选修课程的规划，构建丰富、多元的课程体系，为学生的综合发展、个性成长提供丰富多彩的、高质量的选修课程。
学校要建立以行政班和学生个体为单位的课程实施机制，在条件许可的情况下，逐步建立以学生个体为单位的课程实施机制，鼓励每个学生根据自己的个性兴趣和学习习惯制订专属于自己的课程方案。