个案研究可以依据研究对象、研究内容与目的进行分类。
1.从研究对象分类
（1）以个体为单位的个案研究，即单人的个案。如陈向明老师所做的“王小刚为什么不上学了——一位辍学生的个案调查”，就是最经典的单人个案范例。再比如，北京市某小学一年级教师针对班级小A同学不能集中精力在课堂上学习数学的问题，采用观察、访谈、实验等方法进行个案研究。这项研究就是针对学生学业不良问题展开个案研究。
（2）以社会机构为单位的个案研究，即一个班级、一所学校、一个机关等的个案。如小学语文教师专业引领的现状调查——基于C小学的田野研究就属于此类研究。
（3）以社会团体为单位的个案研究，即学术团体、群众组织等的个案。如北京市教育学会某专业委员会采用科学培训与科学研究方式，不断推出年轻的骨干教师的个案研究，就属于此类研究。
2.从研究内容、目的分类
（1）诊断性个案研究。这类研究主要用于考察特殊儿童，研究异常行为和患有生理疾病者等，目的在于对研究对象的问题现状做出判断。例如，案例小A同学上课集中精力学习数学困难的个案研究，需要采取诊断的方法，对其精力不集中的问题做出判断，以便寻求出研究的对策。
（2）指导性个案研究。这类研究广泛用于教育领域，如用新的教学方法或新的教育方案尝试，然后将研究成果推广到普遍的教育实践中去。
（3）探索性个案研究。这类研究常用于大型研究的准备阶段。例如，目前由于城市改造，北京地区小学生源明显减少，市教委决定开展小班化教育研究。在全市正式开展小班化教育研究之前，市教委成立相关研究小组，对已有研究基础的区县进行探索性个案研究，以便为全市大规模研究做好规划。