综合实践活动课程指导教师的课程实施能力直接影响综合实践活动课程实施的效果，制约综合实践活动课程功能的发挥，并最终影响学生的发展和教师的成长。因此，要使综合实践活动课程得以顺利实施、充分体现其价值，指导教师必须具备全面的课程实施能力。
（一）课程开发能力
综合实践活动课程虽由国家统一设置，但主要还是由地方特别是学校来具体开发和实施。综合实践活动课程的指导教师要有课程意识。教师不仅是课程实施的主体，更是课程的创造者和开发者。教师要以独特的眼光去理解和体验课程，从学生出发，根据学生发展的要求，选择课程内容，变革学习方式。教师要在掌握课程理论的基础上，对综合实践活动课程目标确定的依据、内容的组织、活动方案的设计与编写、实施方式的要求和评价标准等有清晰的了解。此外，教师还要善于开发和利用课程资源，挖掘资源中的教育教学价值。
（二）教学设计能力
以往，学科教师可以完全根据教学大纲的要求和教科书的内容设计教学或编写教案。然而，综合实践活动课程并没有现成的、适合于所有学校和班级的教学参考书、教科书和教学大纲。因此，这就要求指导教师自行设计综合实践活动课程的教学方案，并根据各自的方案进行有特色的教学活动。这对指导教师来说是一种新的尝试，它要求指导教师必须具备教学设计的能力。
传统的教学设计思想以行为主义为理论基础，这种线性的教学设计思想或模式过于僵化和呆板。现代教学设计模式则注重弹性、动态和互动，强调由“教学设计”转向“学习环境设计”，学习环境必须是真实和互动的。这种教学设计模式可以用如下程序来描述：
（1）设定共同主题、制订具体的课题和画出这些课题的关联图；