校本课程的垂直组织要加强各个学习阶段纵向的衔接。多年来，人们已普遍认识到逻辑组织（logical organization）与心理组织（psychological organization）之间的区别。[23]做出这种区别旨在明晰学科领域专家对课程要素之间关系的看法，与学习者对这种关系的看法是不同的。毫无疑问，一方面，在许多情况下，一种逻辑组织——也就是对学科专家有意义的和重要的关系，同时也是一种合适的心理组织——也就是它可能对学习者本身也是有意义的一种编制体系；但在另一方面，学科领域专家所看到的关系，与对学习者本身具有意义发展之间，有时可能会有很大的差别。如历史学科，从古至今尽管是一个简便的组织框架，但是需要非常仔细的考察，看看这一原则是否确定提供了一种心理组织，使学习者对这种组织所涉及的要素有更深入、更广泛的理解。从这个观点来看，按年代顺序组织常常不能令人满意。
（一）考虑学生的兴趣
从学生兴趣的角度来看，学习的效果可能不及由今至古的安排。一般来说，学生对于身边的事物有兴趣。有很多学生觉得历史科没意思，因为都是过去发生的事情，与现在没有什么关系。那么如果在校本课程中采取由今至古的策略，利用近期的时事或身边的生活为入手点，带领学生寻找历史的起源，从而增加学生的学习兴趣，以达至更好的学习效果。因此，有些历史教师会采取从今至古的策略，从学生身边的事件入手，带领学生追溯历史的源头，从而增加学生的学习兴趣，以达至教学的效果。例如，在20世纪90年代初期，回归祖国是香港地区的政治、经济和社会大事。在这个背景下，教师设计了以下的教学次序来让学生学习香港地区和清代的历史（见案例5.1）：[24]