从新中国成立到改革开放前，我国高等学校微观管理体制大体经历了以下几个发展阶段。
（一）校（院）长负责制（1950—1956年）
新中国成立后，中央按照“维持原有学校，逐步加以必要的与可能的改良”的指导思想，对高等学校采取先接管、接收、接办然后予以改造的方法。各高等学校成立校务委员会（临时管委会）作为临时性、过渡性的领导体制，行使管理学校的权力，维持高等学校教学秩序。
1950年4月，中央教育部指示：“高等学校一律实行校长负责制。”同年8月14日，中央教育部颁布了《高等学校暂行规程》，规定“大学及专门学校采校（院）长负责制”，并明确校（院）长的职责如下：“（一）代表学校；（二）领导全校（院）一切教学、研究及行政事宜；（三）领导全校（院）教师、学生、职员、工警的政治学习；（四）任免教师、职员、工警；（五）批准校（院）务委员会决议。[24]”文件还规定，在校（院）长领导下成立校（院）务委员会，负责审查各系及各教研组的教学计划、研究计划及工作报告；通过预算和决算；通过各种重要制度及规章；议决有关学生重大奖惩事项；议决全校（院）重大兴革事项。
1952年我国开始进行院系调整，进一步确立了校（院）长负责制，校（院）长领导高等学校内部的全盘工作，直接向党和国家负责。当时高等学校党的组织实行党组制，即党组成员以行政负责人的身份贯彻党的方针、政策，而学校的党委会和政府机关的党委一样，在政治上起核心作用，不领导行政工作。1955年5月，中宣部《关于学校教育工作座谈会的报告》指出：“学校中的党组织和学校行政互相间都没有领导或指导关系，但应互相帮助，密切配合，为搞好教学、办好学校而协同进行工作。”[25]该报告得到中共中央的支持。1955年8月，中共中央批转中宣部《关于学校教育工作座谈会的报告》，要求各地党委认真研究执行。