（一）督导评估缺乏针对性
对不同学校的督导评估易变成用基础性指标这“一把尺”来衡量，而忽视用发展性指标来评估，或者因为对被评估学校的发展性指标不够了解而流于形式。这样缺乏针对性的评估，既影响了评估的有效性和评估结果的可信度，又不利于调动学校发展的积极性。不同的学校，不同阶段的教育发展水平是不尽相同的，尤其是发展性指标更是反映一个学校的办学特色。因此，对不同学校发展规划的督导评估一定要注意差异性、动态性与发展性。
（二）重材料审阅、轻现场督导
一般在督导评估实施前，督导部门会向被督导单位下达督导方案或督导提纲，并适当提前发出督导通知书。接到通知的学校领导，无疑会腾出人手，甚至命令全校教师停课，有针对性地准备文字材料、应对检查。常常出现的问题是文字材料做得好，忽视实施状况，文字材料的真实性、有效性没有保障，有的学校蒙混过关。若是这样督导就失去了意义，甚至会妨碍正常的教学秩序。
（三）重行政管理督导、轻教育教学督导
在督导过程中，一般督导组主要从学校向督导室递交的书面材料或者是听汇报中了解学校行政管理的方法与手段，较少到实践中核查这些资料和汇报内容的真实性。[18]这就造成有些学校重行政督导，轻教育教学督导，特别是轻课堂教学督导。
（四）督导评估工作形式化
督导之后的结果公布与展示易流于形式、过于简单，督导评估工作的总结、反思和督导回访工作也容易被忽视。