自从轮船参与运漕以来，木帆船过剩的问题就开始凸显，双方矛盾白热化。同治十二年漕粮海运结束后，李鸿章接到了江浙沙、宁船号商郁森盛等人的请愿书，书中提及沙、宁各船历年来都是勤勤恳恳，报效朝廷，现在生计日蹙，唯存漕粮海运这一线希望，商人们恳请朝廷每年能够拨给他们装运漕粮100万石。李鸿章把难题抛给了江苏巡抚张树声，而张树声的回复是：本年应运的漕米有110余万石，应该先尽沙船装载。
招商局“丰顺号”轮船
这绝非李鸿章的本意，在他的授意下，招商局迅速进行反击。朱其昂等人通过苏松太道沈秉成向张树声请愿，指出本年不但不能压缩轮船招商局所运漕粮数额，反而应该予以增加。他们认为沙、宁等船困苦凋敝，“恃运漕为养命之源”，但轮船招商局创办伊始，也是以运漕为立足之基。同治十三年江苏的漕米一共65万石，应仍按“沙八轮二”的比例，即由沙、宁船分运52万石，轮船运13万石。也就是说，应较去年多派3万石给招商局。后来，署布政使应宝时、粮道英朴等人经过商议，决定将沙、卫等船的运载量一律折减，从中提出漕粮正米3万石，并随同商耗2400石，拨归招商局承运。事后，统计这一年轮船招商局所运江苏之米，共11余万石，与上年基本持平。可见轮、沙双方都做了让步。
虽然这场轮、沙之间的斗争最终以和局收场。但是不难发现，洋务派创办招商局，最主要的原因乃是借漕粮海运之名，以兴办洋务运动之实。而沙船业的衰退固然影响了漕粮海运的发展，但是至少在光绪初年以前，沙船并非不敷，而是还有剩余。轮船招商局参与到漕粮海运之中来，对传统的木帆船业造成巨大的冲击。面对处于优势地位的轮船，木帆船欲作最后一搏，故焕发出很大的活力。可是，为了在竞争中获得一席之地，木帆船主将希望寄托于官方的政策倾斜和扶植上，而不通过改造自身来谋求发展，这也预示着它不可避免被淘汰的命运。