分别成立于1884年和1901年的海军军事学院和陆军军事学院，虽然名义上是军事院校，但它们同制订战略计划的专门机构之间存在密切的关联。事实上，自海、陆军军事学院成立以后，在一段时期内一直充当海军部和陆军部的工作小组，在教学之余经常接受海、陆军部指定的战略研究任务，扮演着幕后的角色。甚至在1903年8月陆军总参谋部成立之前，陆军军事学院委员会（War College Board）曾担负着陆军参谋部的职能，1911年仍由总参谋部第3处——军事学院处（War College Division），会同陆军军事学院共商作战计划事宜，直到参加第一次世界大战后被新成立的战争计划局所取代。这2个军事学院“为美国提供一大批多国协同联合作战中掌握战略艺术的高级指挥官和参谋人员。……他们能够与美国政府官员、军队将领、院校领导者一同就战略指挥计划进行深入探索”[15]。
规划未来的战争，是两所军事学院的主要课程之一，其学员毕业后大多数成为美国陆海军高级指挥和参谋人员。例如1942年美国海军所有的四星、三星和大多数两星将军都在海军军事学院有过一至两年的学习经历。[16]第二次世界大战中太平洋舰队总司令切斯特·尼米兹（Chester W.Nimitz）1922—1923年曾在海军军事学院进修，他把战时与平时取得的战略和战术上的成就归功于海军军事学院。[17]而美国参与第二次世界大战时，陆军305名将军中有259名曾是陆军军事学院学员，比例为84.9%。[18]陆军参谋长乔治·马歇尔1906年时曾为进入“威名卓著的陆军军事学院并且获得很高的军衔”而努力学习。[19]盟国远征军总司令艾森豪威尔1927—1928年曾在陆军军事学院进修，当时的校长称赞他的参谋备忘录具有“杰出的贡献”[20]。
此外，陆、海军军事学院的教官和学员定期进行交流，到对方院校进行教学或进修，并开展联合作战计划的研究，这个做法一直沿用至今。[21]例如，1943年时任南太平洋战区司令的海军上将威廉·哈尔西（William F.Halsey，Jr.）1934年在陆军军事学院进修。而陆、海军军事学院的一些院长后来又担任了陆军参谋长、海军作战部长、战争计划局长等要职，如1912—1913年任海军军事学院院长的威廉·罗杰斯（William L.Rodgers），1921—1923年任海军作战部长。1925—1927年任院长的威廉·普拉特（William V.Pratt）在1929—1930年担任海军总司令，1930—1933年任海军作战部长。陆军军事学院的首任院长塔斯克·布利斯是海军军事学院的首期毕业生，后担任过陆军参谋长；1935年任陆军军事学院院长的马林·克雷格（Malin Craig），1936—1939年担任陆军参谋长；20世纪30年代曾任陆军副参谋长兼战争计划局长的斯坦利·恩比克（Stanley D.Embick）和乔治·西蒙兹（George S.Simonds），前者在陆军军事学院当过教官，后者则担任过院长。这些人对美国军事战略计划的制订和未来的战争都有着重要的影响。