1. 儿童急性腹泻
急性腹泻是指每日有3次以上的排便，且每次粪便均为稀水便，时间在2周以内，如果孩子出现急性腹泻的症状，合理使用益生菌可以缩短腹泻和住院的时间。
这种情况下，我们首选布拉氏酵母菌散和双歧杆菌三联活菌散，其次还可以选择双歧杆菌四联活菌片、枯草杆菌二联活菌颗粒、酪酸梭菌活菌散剂、酪酸梭菌二联活菌散、地衣芽孢杆菌活菌颗粒、复合乳酸菌胶囊、双歧杆菌乳杆菌三联活菌片和双歧杆菌三联活菌肠溶胶囊。这些都是常规的益生菌，很容易购买和服用。
2. 儿童抗生素相关性腹泻（AAD）的预防
孩子在用抗生素进行治疗的同时，可能会出现抗生素相关性腹泻，也就是说，因为使用了抗生素，可能会出现肠道菌群紊乱，抗生素干扰糖和脂肪、胆汁酸代谢等问题，从而出现腹泻。合理使用益生菌可以明显降低与抗生素相关的腹泻发生率，也有助于减轻抗生素相关性腹泻的严重程度。
这种情况下，首选布拉氏酵母菌散、酪酸梭菌二联活菌散、双歧杆菌三联活菌散／胶囊、双歧杆菌乳杆菌三联活菌片，其他还包括酪酸梭菌活菌散剂、枯草杆菌二联活菌颗粒和地衣芽孢杆菌活菌颗粒。艰难梭菌相关性腹泻是AAD的一种严重类型，推荐使用布拉氏酵母菌散。
3. 儿童乳糖不耐受的治疗
很多孩子都会出现乳糖不耐受，所谓的乳糖不耐受，是指因为长期腹泻而导致的肠道内乳糖酶缺失，这时需要使用无乳糖奶粉（俗称“腹泻奶粉”）或者适当补充乳糖酶，益生菌辅助治疗婴幼儿乳糖不耐受时，可明显缩短疗程和住院时间。可以选择双歧杆菌乳杆菌三联活菌片、枯草杆菌二联活菌颗粒、双歧杆菌三联活菌散和酪酸梭菌二联活菌散。
4. 儿童功能性便秘