《教育规划纲要》明确指出，要“适应中国国情和时代要求，建设依法办学、自主管理、民主监督、社会参与的现代学校制度，构建政府、学校、社会之间新型关系”。其中“依法办学、自主管理、民主监督、社会参与”指明了现代学校制度的特点，而“构建政府、学校、社会之间的新型关系”，则指出了现代学校制度所要处理的主体之间的关系。总的来说，现代学校制度主要包含两个方面的关系：一是学校和政府、社会之间的关系，即教育的宏观管理制度；二是学校内部各方面的关系，即学校的内部管理制度。在教育的宏观管理制度方面，《教育规划纲要》要求“推进政校分开、管办分离”，“落实和扩大学校办学自主权”。政府部门要适应国家行政管理体制改革要求，树立服务意识，明确权限和职责，改进管理方式，完善管理制度，减少和规范对学校的行政审批事项，依法保障学校充分行使办学自主权。在学校的内部管理制度方面，《教育规划纲要》指出，高等教育要“完善中国特色现代大学制度”，表现在完善治理结构、加强章程建设、扩大社会合作和推进专业评价几个方面；中小学教育要“完善中小学学校管理制度”，表现在完善普通中小学和中等职业学校校长负责制。完善校长任职条件和任用办法。实行校务会议等管理制度，建立健全教职工代表大会制度，不断完善科学民主决策机制。扩大中等职业学校专业设置权。建立中小学家长委员会。引导社区和有关专业人士参与学校管理和监督。发挥企业参与中等职业学校管理和监督。建立中等职业学校与行业企业合作机制。