慕课的学分认证问题也是慕课发展过程中不可忽视的问题，该问题的解决同样是慕课中各相关利益主体极度关注的焦点问题，同时也是慕课发展的重要组成部分。就2012年是美国“慕课元年”来说，慕课备受世人追捧，但是非常滑稽的事件出现了，那就是2013年在美国兴起了“反慕课”的思潮。然而，究其根源就在于，批评者认为，当时流行的慕课课程实质上还是一种传统的课堂教学模式，只不过是搬上了网络而已，教育教学方式未能从根本上发生变革。他们认为，即便从方式上进行了修正完善，但是如何监测慕课的教学质量，能否大范围地引进学分认证和互认，都还需要进一步的研究和设计。从这里就可以明确地发现，慕课的学分认证就是“反慕课”事件的一个重要导火索，只有解决了慕课的学分认证问题，才能更高效地促进和发展慕课这种教育教学模式，并得到社会各界的认可和赞许。
（一）慕课学分认证的重要意义
毋庸置疑，慕课的学分认证是终身教育和终身学习的前提，同时，也是我国乃至世界范围内教育走向大众化和普及化的现实性要求，它也符合学生个性化学习的需要，于是建立有效的慕课学分认证机制，在很大程度上能够很好地促进各国高等教育与网络教育有效交互“立交桥”的科学创建。另外，建立慕课学分认证机制能够打破非正规教育和正规教育、学历教育与非学历教育之间的壁垒，为学生提供多元化和多样性的受教育机会，而且还能够实现教育资源的有效整合与利用，有利于提高教育教学活动的效能，对促进终身学习和全民学习都有极其重要的价值和意义。
这些重大意义主要体现在以下三个方面。[1]首先，促进学生的个性发展和激励学生进行自主学习。在慕课的学分认证机制中，教学计划和课程设置不再是一成不变的，而是为每名学生量身定做的。学生可以获得多样的课程组合，并根据自己的时间和能力自行选择学习课程的顺序，这样有利于调动学生的学习积极性，增强学习效果。同时，有些学生不适合某些课程的学习，但对其他课程的学习却极有兴趣；有些学生不习惯理论知识的学习，却能掌握实际操作的技巧。慕课的学分认证机制能够满足学生的个性需求，针对不同类型的学生实施不同类型的教育，从而有利于学生的个性发展和不同类型人才的培养。其次，服务和谐社会的建设且能符合经济发展的需要。尤其是在就业困难的情况下，如何根据企业发展的需要培养专门人才和培养创新型人才，这些都是慕课所亟待解决的问题。在慕课的学分认证机制下，学生可以自由选择符合企业需求的课程，学习和储备工作中将要用到或今后会用到的知识和技能，而且能够通过学分的转换获得职业资格证书，从而从各个方面提高自己的专业能力，符合企业对人才的要求。另外，在慕课的发展过程中，学分认证机制能够充分体现出慕课教育教学为社会服务、促进社会和谐的特性，并且满足每一名学生多样化的学习需求，从而推动学生不断更新知识，及时提高职业能力、创新能力以及发展能力，且可不断地完善自身。最后，提高教育资源的利用效率。在我国的正规教育系统中，大部分优质教育资源被掌握在公立学校和高等学府里。那些非正规教育系统鉴于教育资源的限制，其教育质量是无法与正规教育系统竞争的，并且一直处于教育的边缘状态，未能获得社会对其应有的重视。慕课的学分认证机制将会打破这一局面，慕课教育机构中的学生在积累了一定的有效学分后获得认可，能够兑换相应的学历或职业资格证书，这样就有利于提高慕课教育及其机构的社会地位和作用，有利于教育资源的共享平台建设，提高教育资源的有效利用率，也能够完善教育的结构体系，促进整个教育事业的和谐健康发展。