综合实践活动的目标设计包括以下几个过程：首先，对照指导纲要，考察活动范围，看活动属于自然领域、社会领域，还是自我这一领域；其次，考虑活动的范围，即是指定领域还是非指定领域，是指定领域中的哪一个领域；然后分析活动的主体；接着设计具体活动的目标，最后设计活动阶段目标。
（一）对照《综合实践活动指导纲要》，考察活动的内容范围
综合实践活动领域包括：人与自然、人与社会和人与自我。这些方面所要达到的目标在综合实践活动的指导纲要中已作了规定，因而在设计目标的时候我们首先要考虑这些目标。比如开展人与自然领域的活动，对照综合实践活动指导纲要，我们可以发现与这一方面有关的活动应该实现以下目标。
1.小学
亲近周围的自然环境，热爱自然，初步形成自觉保护周围自然环境的意识和能力；接触自然，丰富对自然的认识；欣赏自然世界，发展对自然的热爱情怀；通过丰富多彩的活动，理解人与自然不可分割的内在联系；知道如何保护和改善自然环境，并身体力行。
2.初中
增进学生对自然的了解与认识，逐步形成关爱自然、保护环境的思想意识和能力；走进自然，增进对自然的了解与认识，理解人与自然的内在联系；关心自然环境，自主探究自然问题，具有环保意识；参与环境保护的活动，形成初步的环境保护能力。
（二）考察开展的活动领域
《综合实践活动指导纲要》的“总则”部分指出：综合实践活动包括指定领域（研究性学习、社区服务与社会实践、劳动技术教育、信息技术教育）和非指定领域（如班团队活动、校传统活动〈科技节、体育节、艺术节〉、学生的心理健康活动等）。并对指定领域与非指定领域各个方面的具体目标作了规定。因此，在设计活动的具体目标时要注意本主题属于哪一领域，《综合实践活动指导纲要》中又是如何规定的，然后再去制定活动的具体目标。