主题确立阶段，教师需要将学生的各种想法与问题加以归类和整理，并按一定的原则及要求加以分析和梳理，也就是在指导学生整理和分析问题的基础上，指导学生对主题进行分解，正确地表述主题，尽可能避免选择主题常见的错误，指导学生对主题进行论证，最终选择具有研究价值和可能实行的综合实践活动主题。
（一）指导学生整理和分析问题
问题产生以后，就要对学生提出的各种各样问题进行初步的整理和分析，为最终确立主题打好基础。
1.帮助学生分析问题的价值
学生关注的问题五花八门，并不是所有的问题都可以作为综合实践活动的探讨主题，只有具有科学性和研究价值的选题才能成为学生开展探究活动的主题。教师应帮助学生分析主题的价值，通过比较分析的方法，对各种问题的重要性进行筛选，分析哪些问题是主要的，哪些问题是次要的，哪些问题是有所创新的，哪些问题是有待考察的？通过初步分析，为最终确立最有价值的主题提供比较可靠的基础。
2.指导学生将问题进行归类
有些问题本身有一定的价值，但作为综合实践活动的主题缺乏实施的可行性，因此，也不能作为综合实践活动的主题。例如，有的学生提出要研究宇宙问题，虽然有很强的科学性，但对于一般的小学生而言，显得过空、过大，毕竟小学生学习的知识还十分有限，不具备研究的可能性，不能成为开展探究的主题。因此，教师应要求学生先就通过各种途径搜集到的资料、产生的问题进行交流，展开讨论，再引导学生将这若干问题进行归类、整合，从而为问题进行筛选提供前提。
3.指导学生对问题进行筛选
问题的筛选过程，实际上就是对问题去粗取精、去伪存真的过程。去粗取精就是去掉粗糙无用的，选取精华有用的[8]。在问题的筛选过程中，教师要指导学生学会在大量的问题中选择比较重要的关键问题。去伪存真就是去掉假的，保存真的[9]。由于受各方面的客观条件限制，特别是小学生自身知识有限，他们一开始提出的问题不一定都是正确的、真实的，可能存在某些错误的、虚假的问题。在问题筛选过程中，教师指导学生按照去伪存真的原则对问题进行筛选的过程，就是去掉假问题、保存真问题的过程。通过去伪存真，筛选出来问题更真实、更准确、更可靠。