（四）太极
方以智在中年著作《易余》和《东西均》中多言“太极”，但在晚年《一贯问答》中却仅出现一次。于此可以说明方以智晚年渐以“心”为重，客观天道则渐趋偏弱。“太极”之名，最先见于《易》，《系辞上》说：“是故易有太极，是生两仪。”后来，周濂溪《太极图》中说“无极而太极”。到了朱子，“太极”遂成了主要范畴之一。但不执一说的方以智称引“太极”并非承接朱子，因为朱子“太极只当说理”而不可说为“性”[68]。再者，朱子的“太极”不能是“贯古今之於穆太极也”。方以智“太极”的涵义主要取《系辞》“易有太极，是生两仪”之“太极”的“生”意，并引申为“太极非阴阳，而阴阳即太极”或“太极藏身于一切爻”，藉此阐明“体统用、用即体”[69]的道理。
为何说方著中的“太极”与“所以”等一样，就是“天道”呢？他说：
不离有无而不落有无者，贯古今之於穆太极也。贯古今者，不能逃古而今、今而古之轮，犹之无生死者不能逃生而死、死而生之轮。轮直未生前，为不落有无之无，犹轮直核中，为不落仁树之仁。轮直既生后，为不落有无之有，犹轮直芽时，为不落仁树之树。圣人知之，通知一不落有无之洋溢太极，惟适用其有极即无极之贞一卦爻。所谓亘古此阳之一，亘古此阴之一，亘古此不落动静之一，亘古此动静之一者也。[70]
“太极”是“一”，是“贯古今之於穆”，同时亦为无生、无死的绝对存在者。“於穆太极”贯古今，犹仁贯全树。“太极”就是“仁体”，这是无疑的，如他又说：“甲坼参天，何叶不仁？肤粟、足拇有掐之不觉者，谓之不仁。诊知此一法身圆溢周洽，则九十九万毛窍皆太极也。”[71]“仁为生意，故有相通、相贯、相爱之义焉”，有仁必生，生后仁在树中。他说：“大一分为天地，奇生偶而两中参，盖一不住一而二即一者也。”[72]“一不住一”即表明“太极”或“大一”犹种仁一般，遇露必生万物。同时，惟其有“仁”，方犹天道於穆不已、生物不测，他说：“明明上天之载，而无声无臭，是不落有无者也。”[73]此则直接将“太极”说为“天道”。“不离有无”是谓“天道”或“太极”贯于万物，即“太极藏身于一切爻”，为学不能“务偏上以竞高”，不能“执一”而妄谈虚道，要于日行之中见道，在学中悟道；“不落有无”是谓“太极”之无私与遍在。从道德实践上来说，则喻圣人无心以应物而不偏执于外物。